L’Istituto ha un’intensa rete di relazioni scientifiche ed istituzionali. In alcuni casi questi rapporti esterni sono stabili nel tempo e costituiscono un vero e proprio parternariato per la formulazione e realizzazione di progetti in diversi campi. Tra le varie collaborazioni/relazione se ne elencano alcune:
In Italia
Ministero dell’agricoltura, della sovranità alimentare e delle foreste
Ministero della Salute
Regione Lombardia
Ersaf
Associazione Italiana Allevatori
Consiglio per la ricerca in agricoltura e l’analisi dell’economia agraria – CREA
Associazione Regionale Allevatori della Lombardia
Istituto Zooprofilattico Sperimentale della Lombardia e dell’Emilia Romagna
Istituto Zooprofilattico Sperimentale della Sardegna.